室内空气中存在着许多致病微生物，它们的生存期与致病性可以持续很长时间。由于存在致病因素，因此危害更大。
        细菌通过空气传播的常见的流行病、传染病有几十种，例如肺结核、麻疹、白喉、流行性腮腺炎、脑膜炎，流感、花粉症、哮喘、军团君流感也是通过空气和飞沫传播，对人类构成威胁。感染的人在说话、欺，打喷嚏时将病原体排入空气中，并可污染环境物体表面。预防此类疾病，对污染的室内空气和物体表面进行消毒显然是很有意义的。
        各种感染因子会引起医院内感染。院内感染是在医院环境内受到感染而发生的感染性疾病，包括住院病人和陪护人员在医院期间被感染，医院工作人员因医护工作而被感染的疾病。医院既是病院微生物集中的地方，又是抵抗力低的人群聚集场所，而且人们之间还存在一些特殊的接触方式，故医院感染的率是比较高的。引起医院感染的主要病原体有：
        病毒类：病毒性肝炎、HIV、呼吸道病毒、巨细胞病毒、轮状病毒、疱疹病毒、冠状病毒(SARS)等。
       细菌类：金黄色葡萄球菌、其他葡萄球菌和微球菌、A型链球菌、B型链球菌、C型链球菌、G型链球菌、肠球菌、其他溶血性链球菌、厌氧球菌、组织毒素梭状芽孢杆菌、破伤风杆菌、不产芽孢的革兰阴性杆菌、沙门菌、痢疾杆菌、大肠杆菌、变形杆菌、克雷白杆菌、绿脓杆菌、其他假单孢菌、脑膜炎双球菌、无动力杆菌、白喉杆菌、李斯特菌、结核杆菌、无名分枝杆菌、百日咳杆菌等。
       真菌类：有念珠菌、组织胞浆菌、球孢子菌、隐球菌等。